我国原有科技体制是在计划经济体制下逐步形成的，其突出特点是科技资源集中在政府所属独立科研院所。这一体制曾在特定的历史时期，为我国经济发展、国防建设和社会进步作出了重要贡献，也为科学技术自身发展奠定了坚实基础。

随着我国的改革开放进程和社会主义市场经济体制的逐步确立，原有科技体制弊端日益突出。自２０世纪８０年代始，中央决定对科学技术体制进行坚决的、有步骤的改革。

１９８５年，中共中央发布《关于科学技术体制改革的决定》，全面启动了科技体制改革。１９９５年，中共中央、国务院发布《关于加速科学技术进步的决定》，确立了“科教兴国”战略，提出“稳住一头，放开一片”的改革方针，开展了科研院所结构调整的试点工作。１９９９年，中共中央、国务院召开了全国技术创新大会，发布了《关于加强技术创新，发展高科技，实现产业化的决定》，推动应用型科研机构和设计单位向企业化转制，对社会公益类科研机构实行分类改革。２００６年，中央国务院召开了全国科学技术大会，对国家中长期科技发展做出战略部署，发布了《关于实施科技规划纲要，增强自主创新能力的决定》，提出努力形成技术创新、知识创新、国防科技创新、区域创新、科技中介服务等相互促进、充满活力的国家创新体系。

经过多年的努力，我国科技体制改革取得了重要进展和显著成效。改革以前，国科研力量和科技资源主要集中在独立科研机构。１９９９年时，中央级科研院所共有１０００多家，其中产业部门３７０多家，中科院１２０多家，公益部门等所属有３００多家，军工院所２５０多家。到目前，除军工院所外，产业部门所属３７０多家已全部完成企业化转制（包括１３家中科院研究所），公益类院所２６５家已明确改革方案，在中央级非军工院所中，已完成企业化转制的接近一半；此外，地方也有近９００家开发类院所完成企业化转制。初步形成了科研院所、高校、企业和科技中介机构等各具优势和特色的创新主体。

科技体制改革在优化科技力量结构和布局的同时，还促进了科技与经济的紧密结合；不仅推动了我国科技事业的发展，还为社会经济发展提供了有力的科技支撑。据统计，２００７年２４７家中央级转制院所承担来自企业的委托开发经费１２７亿元，是２０００年的４倍；申报专利３６７４项，转让技术成果１６４２个，直接受益企业达１．１２万家。